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Presentations (2012~Current)

Oral

  1. 曽超, RNA標的創薬のための統合データベース, NGS EXPO, 2024/9/4~6, 大阪 (招待講演)

  2. Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada, Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines, 第24回日本RNA学会年会, 2023/7/5~7, 那覇

  3. 福永津嵩, 曽超, 浜田道昭, 機能エレメントに基づくRNAの機能解析実習, BINDS発現機能解析インシリコ融合ユニット講習会, 2022/10/1, 早稲田大学

  4. Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada, Genome-based assembly and analysis of semi-extractable RNAs, RNAインフォマティクス道場2022, 2022/8/24~28, 宮崎

  5. Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Michiaki Hamada, Bioinformatic approaches for understanding RNA reincarnation, 第43回日本分子生物学会, 2020/12/2~4, オンライン開催

  6. Chao Zeng, Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada, Identification and characterisation of ribosome-associated lncRNAs in human and mouse, RNA bioinformatics, 2019/9/9~11, Wellcome Genome Campus (UK)

  7. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Identifying sequence features that drive ribosomal association for lncRNA, The 29th International Conference on Genome Informatics(GIW2018), 2018/12/03~05, Kunming (China)

  8. 天津早貴, 岡田航, 曽超, 中條岳志, 廣瀬哲郎, 浜田道昭, architectural RNA配列の特徴抽出, 生命科学系フロンティアミーティング2018 (生命情報科学若手の会第10回研究会), 2018/10/5~7, 静岡県三島市

  9. Chao Zeng, Michiaki Hamada, A comprehensive analysis of the effects of alternative splicing on RNA localization in human, 第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018), 2018/09/19~21, 山形県鶴岡市

  10. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Integrative analysis of multiple ribosome profiling datasets reveals widespread lncRNA-ribosome interaction in mammals, 第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2017), 2017/09/27~29, 札幌

  11. Chao Zeng, Hiroaki Iwata, Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Osamu Gotoh, Mapping and Aligning PacBio RNA-seq Data, The Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB2012), 2012/12/20~21, Shenzhen (China)

Posters

  1. Xinyue Gao, Kenzui Taniue, Anzu Sugawara, Chao Zeng, Han Han, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Michiaki Hamada, Nobuyoshi Akimitsu, The MTR4/hnRNPK complex-mediated degradation of aberrant polyadenylated RNAs with multiple exons, 第25回日本RNA学会, 2024/6/26~28, 東京

  2. Ryoma Yamawaki, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Sequence characterization and prediction of semi-extractable RNAs, 第25回日本RNA学会, 2024/6/26~28, 東京

  3. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Comprehensive Database for RNA-Targeting Drug Discovery, 第25回日本RNA学会, 2024/6/26~28, 東京

  4. Saki Fujiwara, Naoko Fujiwara, Takeshi Chujo, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Tetsuro Hirose, Exploring architectural RNAs associated to cellular senescence, 第25回日本RNA学会, 2024/6/26~28, 東京

  5. Ryotaro Yanoshita , Eito Ichihashi, Mai Kubota, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Masayuki Sakurai, Identify the effect of R-loop on transcriptional regulatory mechanisms, 第25回日本RNA学会, 2024/6/26~28, 東京

  6. Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada, Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines, RNA 2024, 2024/5/28~6/1, Edinburgh

  7. 金子修士, 藤原奈央子, 曽超, 浜田道昭, 廣瀬哲郎, 中條岳志, 血清飢餓ストレスによって誘導される新規難溶性architectural RNA SISTの解析, 第46回日本分子生物学会年会, 2023/12/6~8, 神戸

  8. 若林佑太郎, 下野愛夏, 石川公輔, 曽超, 浜田道昭, 渡辺慎哉, 仙波憲太郎, 小胞体ストレスに応答する新規lncRNA TISPLの転写メカニズムおよび機能の解明, 第46回日本分子生物学会年会, 2023/12/6~8, 神戸

  9. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Integrated database for RNA-targeting drug discovery, Cold Spring Harbor Asia Conference: The Now and Future of RNA Therapeutics, 2023/6/19~23, Awaji

  10. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines / 5種類のヒト細胞株における難溶性RNAのランドスケープ, 先進ゲノム支援2022年度拡大班会議, 2023/1/19, パシフィコ横浜

  11. Aika Shimono, Yutaro Wakabayashi, Kosuke Ishikawa, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Shinya Watanabe, Kentaro Semba, Transcriptional mechanism of TISPL, a novel lncRNA-coding gene that responds to endoplasmic reticulum stress / 小胞体ストレスに応答する新規lncRNA TISPLの転写メカニズムの解明, 第45回日本分子生物学会年会, 2022/11/30~12/2, 幕張メッセ

  12. Nagi Yoshitsugu, Yu Hamaguchi, Chao Zeng and Michiaki Hamada, レファレンスフリーツールを含む発現変動解析ツールの比較, 第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022), 2022/9/13~15, 大阪

  13. Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada, De novo assembly and characterization of semi-extractable RNAs, 第23回日本RNA学会年会, 2022/7/20~22, 京都

  14. Eito Ichihashi, Mai Kubota, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Kazuko Nisikura, Yusuke Siromoto, Masayuki Sakurai, Identify the effect of R-loop on transcriptional regulatory mechanisms, 第23回日本RNA学会年会, 2022/7/20~22, 京都

  15. 曽 超、浜田 道昭, リピート配列由来の機能エレメントの探索, 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021), 2021/9/27~29, オンライン開催

  16. Ryo Niwa, Chao Zeng and Michiaki Hamada, 転写因子結合部位として働く反復配列の発見とその機能の解明, 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021), 2021/9/27~29, オンライン開催

  17. Yu Hamaguchi, Chao Zeng and Michiaki Hamada, ヒト遺伝子アノテーションがRNA-seq解析に与える影響の評価, 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021), 2021/9/27~29, オンライン開催

  18. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Searching for Repeat-derived Functional Elements in RNAs, 第22回日本RNA学会年会, 2021/7/7~9, オンライン開催

  19. Masahiro Onoguchi, Chao Zeng, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Binding Patterns of RNA Binding Proteins To Repeat-Derived RNA Sequences Reveal Putative Functional RNA Elements, 第22回日本RNA学会年会, 2021/7/7~9, オンライン開催

  20. Masahiro Onoguchi, Chao Zeng, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Binding patterns of RNA binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements, Noncoding RNAs: Biology and Applications (Keystone Symposia), 2021/5/11~14, Virtual

  21. Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Risa Maemura, Michiaki Hamada, Sequence characterization of R-loop-forming RNAs in mammals, Transposable Elements (CSH), 2020/10/6~9, Visual

  22. 髙橋聡、野呂林太郎、吉川明子、中道真仁、菅野哲平、松本優、武内進、平尾真季子、松田久仁子、Chao Zeng、浜田道昭、久保田馨、清家正博、弦間昭彦, ドライバー遺伝子異常肺癌の薬剤耐性機序における長鎖ノンコーディングRNAの意義/Significance of long non-coding RNA associated with drug resistance in lung cancer with driver mutation, 第60回日本呼吸器学会学術講演会, 2020/9/20~22, WEB開催

  23. Saki Amatsu, Wataru Okada, Yu Hamaguchi, Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada, in silico解析によるarchitectural RNA共通特徴の発見, 第9回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020), 2020/9/1~3, オンライン開催

  24. 天津早貴, 岡田航, 浜口悠, 曽超, 小野口真広, 中條岳志, 廣瀬哲郎, 浜田道昭, in silico解析によるarchitectural RNA共通特徴の発見, 生命情報科学若手の会(第12回研究会), 2020/8/27~28, オンライン開催

  25. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Deciphering the effects of alternative splicing on RNA subcellular localization, Noncoding RNAs: Mechanism, Function and Therapies (Keystone Symposia), 2020/1/12~16, Fairmont Chateau Whistler (Canada)

  26. Masahiro Onoguchi, Chao Zeng, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Analysis and estimation of functional domains of lncRNAs using eCLIP data, Noncoding RNAs: Mechanism, Function and Therapies (Keystone Symposia), 2020/1/12~16, Fairmont Chateau Whistler (Canada)

  27. 曽超、浜田道昭, リボソームプロファイリングデータのin silico解析：事例紹介/In silico analysis of ribosome profiling data: case studies, 先進ゲノム支援拡大班会, 2019/12/16~17, ホテルメルパルク名古屋

  28. 浜口悠, 曽超, 浜田道昭, 長鎖非コードRNA研究におけるRNA-seq解析パイプラインの評価/Assessment of RNA-seq analysis pipelines for lncRNAs , 先進ゲノム支援拡大班会, 2019/12/16~17, ホテルメルパルク名古屋

  29. 小野口真広、曽超、松丸綾子、浜田道昭, 転写産物中に存在する反復配列に結合するRNA結合タンパク質の解析 /Analysis of RNA binding proteins associated with repeat-derived RNAs, 先進ゲノム支援拡大班会, 2019/12/16~17, ホテルメルパルク名古屋

  30. 韓晗, 山田俊理, 曽超, 浜田道昭, 鈴木穣, 秋光信佳, Role of MTR4, an RNA Decay Factor, in Nuclear mRNA Quality Control (RNA分解因子MTR4が核内ｍRNA品質管理に果たす役割の解明), 先進ゲノム支援拡大班会, 2019/12/16~17, ホテルメルパルク名古屋

  31. Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Yu Hamaguchi, Michiaki Hamada, Detecting differentially expressed genomic regions from RNA-seq/RNA-seqデータより発現変動ゲノム領域の検出手法, 第42回日本分子生物学会年会, 2019/12/2~6, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡

  32. 小野口真広、曽超、松丸綾子、浜田道昭, eCLIPデータを用いた機能性RNA反復配列の推定/Estimation of functional repeat-derived RNAs using eCLIP data, 第42回日本分子生物学会年会, 2019/12/2~6, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡

  33. 若林佑太郎、寺内由希、石川公輔、曽超、小林雄太、浜田道昭、渡辺慎哉、仙波憲太郎, 小胞体ストレスに誘導されるlncESITに関する発現・機能解析/Expression and Function Analyses of lncESIT Induced by Endoplasmic Reticulum Stress, 第42回日本分子生物学会年会, 2019/12/2~6, 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡

  34. 鈴木ゆりあ，曽超, 浜⽥道昭，二次構造を考慮したCRISPR/Cas13 crRNAのデザインツール開発，第11回生命情報科学若手の会, 2019/10/18〜20, 富士Calm

  35. 韓晗, 山田俊理, 曽超, 浜田道昭, 鈴木穣, 秋光信佳, Role of MTR4, an RNA Degradation Factor, in Nuclear mRNA Quality Control (RNA分解因子MTR4が核内のｍRNA品質管理に果たす役割の解明), RNA Frontier Meeting 2019, 2019/9/24~26, 静岡県伊豆市(IBM天城ホームステッド)

  36. 浜口悠, 曽超, 浜田道昭, lncRNA 研究におけるにおけるRNA-seq解析手法の評価 (Benchmarking of RNA-seq analysis methods for lncRNAs), RNA Frontier Meeting 2019, 2019/9/24~26, 静岡県伊豆市(IBM天城ホームステッド)

  37. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Differentially Expressed Genomic REgion Estimation (DEGREE) for RNA-seq data, 先進ゲノム支援班会議, 2019/8/27-28, 東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト(千葉)

  38. 浜口悠, 曽超, 浜田道昭, lncRNA研究における転写産物レベルでのRNA-seq解析手法の評価, 先進ゲノム支援班会議, 2019/8/27-28, 東京大学柏の葉キャンパス駅前サテライト(千葉)

  39. 曽超, 浜田道昭, 選択的スプライシングがRNAの細胞内局在に与える影響のゲノムワイド解析 (Genome-wide analysis of the effects of alternative splicing on RNA subcellular localization), 第21回日本RNA学会年会, 2019/7/17~19, 東京

  40. 浜口悠, 曽超, 浜田道昭, lncRNA研究におけるRNA-seq解析パイプラインの評価 (Benchmarking of RNA-seq analysis pipelines for lncRNAs), 第21回日本RNA学会年会, 2019/7/17~19, 東京

  41. 天津早貴，岡田航，浜口悠，曽超，小野口真広，中條岳志，廣瀬哲郎，浜田道昭, architectural RNA配列の特徴抽出 (Characterization of Architectural RNA Sequences), 第21回日本RNA学会年会, 2019/7/17~19, 東京

  42. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Study on the effects of alternative splicing on RNA localization, 先進ゲノム支援2018年度拡大班会議, 2018/12/20~21, 福岡「ライトニングトーク、ポスター発表」

  43. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Computational analyses for omics data, 先進ゲノム支援2018年度拡大班会議, 2018/12/20~21, 福岡「ライトニングトーク、ポスター発表」

  44. Yu Hamaguchi, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Evaluation of RNA-seq analysis methods at transcript level using simulation data, 先進ゲノム支援2018年度拡大班会議, 2018/12/20~21, 福岡「ライトニングトーク、ポスター発表」

  45. Chao Zeng, Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada, Identification and analysis of ribosome-associated lncRNAs using ribosome profiling data, 新学術領域先進ゲノム班会議2018, 2018/08/20~21, 静岡県三島市「ライトニングトーク、ポスター発表」

  46. 曽超, 福永津嵩, 浜田道昭, リボソームプロファイリングデータを用いたリボソーム関連する長鎖ノンコーディングRNAの同定と解析, 第20回日本RNA学会年会, 2018/07/09~11, 大阪

  47. Chao Zeng, Michiaki Hamada, Alternative splicing determines subcellular localization of RNAs: a hypothesis, 第20回日本RNA学会年会, 2018/07/09~11, 大阪

  48. Chao Zeng, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada, Ribosome profiling reveals the plurality of ribosome-associated long non-coding RNAs in mammals, 第19回日本RNA学会年会, 2017/07/19~21, 富山

  49. 曽超, 福永津嵩, 浅井潔, 浜田道昭, Identification and classification of translational pausing and ribosome-associated lncRNAs, 第五回NGS現場の会, 2017/05/22~24, 仙台

  50. Chao Zeng, Kiyoshi Asai, Exploring the Effects of mRNA Sequence Features on Ribosome Pausing, The 21st Annual Meeting of the RNA Society(RNA2016), 2016/06/28~07/02, 京都

  51. Chao Zeng, Hiroaki Iwata, Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Osamu Gotoh, Detection of Splice Junctions from Mid-to-Long RNA-seq Reads by SPALN, The International Conference on Genome Informatics Workshop (GIW2012), 2012/12/12~14, Tainan(Taiwan)

  52. Chao Zeng, Hiroaki Iwata, Osamu Gotoh, Mapping Middle-to-Long RNA-seq Reads onto Genomic Sequence, 生命医薬情報学連合大会[JSBi2012], 2012/12/14~17, 東京